模拟蛋白质的并行分子动力学计算程序
可以拼接来自多个平台的测序数据
一个快速的将RNA-Seq数据进行快速剪接映射的程序
一款商业软件,但是如果只是科研用途的话
用于大型和复杂宏基因组学NGS读取的单节点汇编程序
序列组装程序
一款很经典的构建进化树的软件
使用贝叶斯方法构建系统发育树
一款利用最大似然法对DNA或蛋白质序列进行系统发育分析的软件包
中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物
用于拼接短序列组装
一个短序列的从头拼接软件
分子动力学相关的一些计算和模拟工作
超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组
一套广为应用的并行分子动力学模拟软件
一个快速比对两个基因组序列的软件
准确度和强大的功能，能够整合很多信息,如结构信息
一套与高通量测序数据交互的程序
通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能
一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较
通过搜索蛋白质或DNA数据库，或通过识别序列中的局
并行ClustalW
一种渐进的多序列比对方法,先将多个序列两两比对构建
用于研究生物分子体系的分子动力学程序包
基于隐马尔可夫模型,用于生物序列分析工作的一个非常
欧洲分子生物学开放软件包,一个开源的序列分析软件包
